理研サイネスご利用の皆様

理研のバイオインフォマティクスに関する技術を検討するバイオインフォマティクス 検討委員会(2015年2月26日)において、理研サイネスは2015年4月から2か月程度の データベース移行期間の後停止させることが決まりました。 理研サイネス上のデータベースはすべてデータベース作業部会で精査され、引き続き 公開が必要なデータベースについては、新たなデータベース「理研メタデータベー ス」への移行が済み、すでに公開されていることを確認しました。これにより、2015 年6月1日をもって理研サイネスのサービスを停止させることとなりました。 今後は、広く研究者の皆様に理研の生命科学系データを活用していただきたく、デー タ流通を第一義として開発した「理研メタデータベース」(http://metadb.riken.jp) をご利用ください。

理化学研究所 情報基盤センター
Researchers with projects affiliated with RIKEN may input their project reference as an instance in the Database Registry.

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Researcher Database
Bioresources

RIKEN BASE

Database Registry

External ID http://biolod.org
Date last modified 2012-10-29
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Database Registry
target species (taxonomy)
SciNetS project URI
Attribution update
  WDDD: Worm Developmental Dynamics Database
Caenorhabditis elegans
- http://so.qbic.riken.jp/wddd/ 2013-08-14
  Thermus thermophilus HB8 Whole-Cell Project Database - - http://www.srg.harima.riken.jp/h_db/index.html 2012-09-03
  RAFL cDNA
Arabidopsis thaliana
http://scinets.org/item/ria11i
http://rarge.psc.riken.jp/cdna/cdna_keyword.pl 2011-05-10
  Arabidopsis full length cDNA promoter
Arabidopsis thaliana
http://scinets.org/item/ria12i
http://rarge.psc.riken.jp/cdna/promoter/index.pl 2011-05-10
  RARGE Alternative splicing
Arabidopsis thaliana
http://scinets.org/item/ria3i
http://rarge.psc.riken.jp/a_splicing/index.pl 2011-05-10
  RARGE Transposon Mutant
Arabidopsis thaliana
http://scinets.org/item/ria10i
http://rarge.psc.riken.jp/dsmutant/index.pl 2011-05-10
  EdgeExpressDB
Homo sapiens
http://scinets.org/item/ria281i
http://fantom.gsc.riken.jp/4/edgeexpress/view/index.php#5558263 2011-04-28
  Phenotype Platform SOPs
Mus musculus
http://www.brc.riken.jp/lab/bpmp/SOPs/index.html 2011-04-27
  ENU Mutants ENU Mutants ENU Mutants ENU Mutants
Mus musculus
http://scinets.org/item/rib190i
http://www.brc.riken.jp/lab/gsc/mouse/index.html 2011-04-27
  SDOP-DB
Mus musculus
http://www.brc.riken.jp/lab/bpmp/SDOP/index.html 2011-04-27
  Japan Mouse Clinic
Mus musculus
http://scinets.org/item/ria110i
http://www.brc.riken.jp/lab/jmc/mouse_clinic/en/index.html 2011-04-27
  RIPP-DB
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa
http://scinets.org/item/ria102i
https://database.riken.jp/sw/en/Plant_Phosphoproteome_Database/ria102i/ 2011-04-26
  FOX Hunting
Arabidopsis thaliana
http://scinets.org/item/ria61i
https://database.riken.jp/sw/ja/FOX_Hunting_/ria61i/ 2011-04-26
  ARTADE2DB
Arabidopsis thaliana
http://scinets.org/item/ria227i
http://matome.base.riken.jp/omat_gene_db/ 2011-04-08
  The RIKEN integrated database of mammals
Mus musculus
Homo sapiens
Rattus norvegicus
Pan troglodytes
http://scinets.org/item/ria254i
http://scinets.org/db/mammal 2011-04-19
  The Chloroplast Function Database
Arabidopsis thaliana
- http://rarge.psc.riken.jp/chloroplast 2010-10-21
  LegumeTFDB
Glycine max
Lotus japonicus
Medicago truncatula
- http://legumetfdb.psc.riken.jp/ 2010-10-21
  Striga hermonthica EST Database
Striga hermonthica
- http://striga.psc.riken.jp/strigaDB/ 2010-10-21
Radiosynthesis Database of PET Probe - - http://www.nirs.go.jp/research/division/mic/db2/ 2011-04-12
RIKEN Plant Hormone Research Network
Arabidopsis thaliana
- http://hormones.psc.riken.jp/ 2010-08-10
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